Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika

Resistensi antibiotika muncul sebagai polemik yang dapat mempengaruhi kesehatan manusia. Kemajuan teknologi membuka peluang dalam penemuan molekul senyawa baru yang mampu mencegah perkembangan mikroba patogen, seperti Pseudomonas aeruginosa yang resisten terhadap beberapa jenis antibiotika. Terapi f...

Descripción completa

Guardado en:

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Taufik Muhammad Fakih, Anggi Arumsari, Mentari Luthfika Dewi, Nurfadillah Hazar, Tanisa Maghfira Syarza
Formato:	article
Lenguaje:	EN ID
Publicado:	UIN Sunan Gunung Djati Bandung 2021
Materias:	fotosensitizer terapi fotodinamika pseudomonas aeruginosa protein hemofor besi-ftalosianina besi-salofen studi in silico Chemistry QD1-999
Acceso en línea:	https://doaj.org/article/0f9cbe93c6644c589448dbd52337e861
Etiquetas:	Agregar Etiqueta Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!

id	oai:doaj.org-article:0f9cbe93c6644c589448dbd52337e861
record_format	dspace
spelling	oai:doaj.org-article:0f9cbe93c6644c589448dbd52337e8612021-11-11T04:40:36ZSimulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika2407-18972407-192710.15575/ak.v8i1.8502https://doaj.org/article/0f9cbe93c6644c589448dbd52337e8612021-06-01T00:00:00Zhttps://journal.uinsgd.ac.id/index.php/ak/article/view/8502https://doaj.org/toc/2407-1897https://doaj.org/toc/2407-1927Resistensi antibiotika muncul sebagai polemik yang dapat mempengaruhi kesehatan manusia. Kemajuan teknologi membuka peluang dalam penemuan molekul senyawa baru yang mampu mencegah perkembangan mikroba patogen, seperti Pseudomonas aeruginosa yang resisten terhadap beberapa jenis antibiotika. Terapi fotodinamika dengan memanfaatkan penggunaan fotosensitizer yang berasal dari senyawa yang membentuk kompleks dengan besi merupakan salah satu pendekatan alternatif untuk mengatasi penyakit infeksi dengan risiko resistensi mikroba yang lebih rendah. Penelitian yang dilakukan secara in silico ini bertujuan untuk mengamati, mengeksplorasi, dan mengevaluasi mekanisme aksi berbasis struktural dari molekul senyawa yang membentuk kompleks dengan besi, yaitu besi-ftalosianina dan besi-salofen terhadap protein hemofor HasAp serta pengaruh molekularnya terhadap bagian situs aktif pengikatan dari protein hemofor HasR. Identifikasi interaksi molekuler dan afinitas antara molekul senyawa besi-ftalosianina dan besi-salofen terhadap protein hemofor HasAp dilakukan dengan simulasi ligan-protein docking mempergunakan software MGLTools 1.5.6 yang dilengkapi dengan AutoDock 4.2. Di samping itu, dilakukan juga simulasi protein-protein docking terhadap sistem kompleks ligan-protein untuk memastikan pengaruh molekularnya terhadap bagian situs aktif pengikatan dari protein hemofor HasR dengan mempergunakan software PatchDock. Berdasarkan simulasi ligan-protein docking diperoleh hasil bahwa senyawa besi-ftalosianina memiliki afinitas paling baik terhadap kedua protein hemofor HasAp, dengan nilai energi bebas pengikatan masing-masing sebesar −68,45 kJ/mol dan −65,23 kJ/mol. Menariknya, hasil simulasi protein-protein docking antara kompleks molekul senyawa besi-ftalosianina dan protein hemofor HasAp-besi-ftalosianina terhadap protein hemofor HasR memiliki nilai energi kontak atom yang positif sebesar 556,56 kJ/mol. Dari penelitian ini dapat diprediksikan bahwa perbedaan struktur molekul senyawa yang membentuk kompleks dengan besi mampu mempengaruhi mekanisme aksi berbasis structural terhadap protein hemofor target.Taufik Muhammad FakihAnggi ArumsariMentari Luthfika DewiNurfadillah HazarTanisa Maghfira SyarzaUIN Sunan Gunung Djati Bandungarticlefotosensitizerterapi fotodinamikapseudomonas aeruginosaprotein hemoforbesi-ftalosianinabesi-salofenstudi in silicoChemistryQD1-999ENIDΑl-Kimiya: Jurnal Ilmu Kimia dan Terapan, Vol 8, Iss 1, Pp 1-8 (2021)
institution	DOAJ
collection	DOAJ
language	EN ID
topic	fotosensitizer terapi fotodinamika pseudomonas aeruginosa protein hemofor besi-ftalosianina besi-salofen studi in silico Chemistry QD1-999
spellingShingle	fotosensitizer terapi fotodinamika pseudomonas aeruginosa protein hemofor besi-ftalosianina besi-salofen studi in silico Chemistry QD1-999 Taufik Muhammad Fakih Anggi Arumsari Mentari Luthfika Dewi Nurfadillah Hazar Tanisa Maghfira Syarza Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
description	Resistensi antibiotika muncul sebagai polemik yang dapat mempengaruhi kesehatan manusia. Kemajuan teknologi membuka peluang dalam penemuan molekul senyawa baru yang mampu mencegah perkembangan mikroba patogen, seperti Pseudomonas aeruginosa yang resisten terhadap beberapa jenis antibiotika. Terapi fotodinamika dengan memanfaatkan penggunaan fotosensitizer yang berasal dari senyawa yang membentuk kompleks dengan besi merupakan salah satu pendekatan alternatif untuk mengatasi penyakit infeksi dengan risiko resistensi mikroba yang lebih rendah. Penelitian yang dilakukan secara in silico ini bertujuan untuk mengamati, mengeksplorasi, dan mengevaluasi mekanisme aksi berbasis struktural dari molekul senyawa yang membentuk kompleks dengan besi, yaitu besi-ftalosianina dan besi-salofen terhadap protein hemofor HasAp serta pengaruh molekularnya terhadap bagian situs aktif pengikatan dari protein hemofor HasR. Identifikasi interaksi molekuler dan afinitas antara molekul senyawa besi-ftalosianina dan besi-salofen terhadap protein hemofor HasAp dilakukan dengan simulasi ligan-protein docking mempergunakan software MGLTools 1.5.6 yang dilengkapi dengan AutoDock 4.2. Di samping itu, dilakukan juga simulasi protein-protein docking terhadap sistem kompleks ligan-protein untuk memastikan pengaruh molekularnya terhadap bagian situs aktif pengikatan dari protein hemofor HasR dengan mempergunakan software PatchDock. Berdasarkan simulasi ligan-protein docking diperoleh hasil bahwa senyawa besi-ftalosianina memiliki afinitas paling baik terhadap kedua protein hemofor HasAp, dengan nilai energi bebas pengikatan masing-masing sebesar −68,45 kJ/mol dan −65,23 kJ/mol. Menariknya, hasil simulasi protein-protein docking antara kompleks molekul senyawa besi-ftalosianina dan protein hemofor HasAp-besi-ftalosianina terhadap protein hemofor HasR memiliki nilai energi kontak atom yang positif sebesar 556,56 kJ/mol. Dari penelitian ini dapat diprediksikan bahwa perbedaan struktur molekul senyawa yang membentuk kompleks dengan besi mampu mempengaruhi mekanisme aksi berbasis structural terhadap protein hemofor target.
format	article
author	Taufik Muhammad Fakih Anggi Arumsari Mentari Luthfika Dewi Nurfadillah Hazar Tanisa Maghfira Syarza
author_facet	Taufik Muhammad Fakih Anggi Arumsari Mentari Luthfika Dewi Nurfadillah Hazar Tanisa Maghfira Syarza
author_sort	Taufik Muhammad Fakih
title	Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
title_short	Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
title_full	Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
title_fullStr	Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
title_full_unstemmed	Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika
title_sort	simulasi penambatan molekuler senyawa kompleks besi terhadap protein hemofor sebagai kandidat fotosensitizer pada terapi fotodinamika
publisher	UIN Sunan Gunung Djati Bandung
publishDate	2021
url	https://doaj.org/article/0f9cbe93c6644c589448dbd52337e861
work_keys_str_mv	AT taufikmuhammadfakih simulasipenambatanmolekulersenyawakompleksbesiterhadapproteinhemoforsebagaikandidatfotosensitizerpadaterapifotodinamika AT anggiarumsari simulasipenambatanmolekulersenyawakompleksbesiterhadapproteinhemoforsebagaikandidatfotosensitizerpadaterapifotodinamika AT mentariluthfikadewi simulasipenambatanmolekulersenyawakompleksbesiterhadapproteinhemoforsebagaikandidatfotosensitizerpadaterapifotodinamika AT nurfadillahhazar simulasipenambatanmolekulersenyawakompleksbesiterhadapproteinhemoforsebagaikandidatfotosensitizerpadaterapifotodinamika AT tanisamaghfirasyarza simulasipenambatanmolekulersenyawakompleksbesiterhadapproteinhemoforsebagaikandidatfotosensitizerpadaterapifotodinamika
_version_	1718439560386445312

Simulasi Penambatan Molekuler Senyawa Kompleks Besi Terhadap Protein Hemofor sebagai Kandidat Fotosensitizer pada Terapi Fotodinamika

Ejemplares similares