بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران

جنس Seidlitzia دارای چهار گونه در ایران است. گونه S. rosmarinus به شکل درختچه‌ای و سه گونه دیگر علفی هستند. هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی 85 نمونه گیاهی 17 جمعیت گونه S. rosmarinus و پی بردن به شناسایی احتمالی فرم‌های تاکسونومیکی پایین‌تر از سطح گونه با استفاده از نشانگر مولکول...

Descripción completa

Guardado en:

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	شیما صدیقی, علیرضا ایرانبخش, سیدمهدی حمدی, ایرج مهرگان
Formato:	article
Lenguaje:	EN FA
Publicado:	Agricultural Research, Education and Extension Organization 2021
Materias:	آنالیز واریانس مولکولی تاج‌خروسیان تجزیه خوشه‌‌ای روش upgma Botany QK1-989
Acceso en línea:	https://doaj.org/article/43c4128f9137498e9334ea5ebe44f711
Etiquetas:	Agregar Etiqueta Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!

id	oai:doaj.org-article:43c4128f9137498e9334ea5ebe44f711
record_format	dspace
spelling	oai:doaj.org-article:43c4128f9137498e9334ea5ebe44f7112021-11-08T04:44:16Zبررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران1608-43062423-660810.22092/botany.2021.351400.1213https://doaj.org/article/43c4128f9137498e9334ea5ebe44f7112021-09-01T00:00:00Zhttps://rostaniha.areeo.ac.ir/article_123349_1819c77c998fb9f0586a9490d9cd139b.pdfhttps://doaj.org/toc/1608-4306https://doaj.org/toc/2423-6608جنس Seidlitzia دارای چهار گونه در ایران است. گونه S. rosmarinus به شکل درختچه‌ای و سه گونه دیگر علفی هستند. هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی 85 نمونه گیاهی 17 جمعیت گونه S. rosmarinus و پی بردن به شناسایی احتمالی فرم‌های تاکسونومیکی پایین‌تر از سطح گونه با استفاده از نشانگر مولکولیISSR بود. از 16 پرایمر عمومی و چهار پرایمر اختصاصی استفاده شد که در مجموع 221 باند ایجاد کردند. دندروگرام داده‌هایISSR مربوط به 17 جمعیت براساس ماتریس تشابه به روشUPGMA و ضریب تشابهDice از 40/0 تا 96/0 متغیر بود. براساس آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA)، بیشترین تنوع (68%) تنوع درون جمعیتی، 28% تنوع بین جمعیتی و 4% مربوط به تنوع بین مناطق بود. آنالیزMCMC به منظور بررسی ساختار ژنتیکی در جمعیت‌های گونهS. rosmarinus مورد بررسی قرار گرفت. همچنین، آنالیز مختصات اصلی به روشPCOA براساس محور مختصات اصلی اول و دوم برای نشانگرISSR انجام شد که این روش به عنوان روش مکمل برای تجزیه خوشه‌ای با هدف استفاده بهینه و استخراج حداکثری اطلاعات از داده‌های مولکولی ارایه شد. نتایج به دست آمده از نشانگرISSR از درجه اطمینان بالایی برخوردار بود. نتایج به دست آمده با استفاده از نشانگرISSR نشان داد که نسبت به سایر نشانگرها دقت بیشتری داشته و روابط بین جمعیت‌ها را با وضوح بهتری نمایان ساخت. از طرفی، فرم‌های تاکسونومیکی احتمالی پایین‌تر از سطح گونه با توجه به اختلافات کم بین جمعیت‌ها مشاهده نشد.شیما صدیقیعلیرضا ایرانبخشسیدمهدی حمدیایرج مهرگانAgricultural Research, Education and Extension Organizationarticleآنالیز واریانس مولکولیتاج‌خروسیانتجزیه خوشه‌‌ایروش upgmaBotanyQK1-989ENFAرستنی‌ها, Vol 22, Iss 1, Pp 20-29 (2021)
institution	DOAJ
collection	DOAJ
language	EN FA
topic	آنالیز واریانس مولکولی تاج‌خروسیان تجزیه خوشه‌‌ای روش upgma Botany QK1-989
spellingShingle	آنالیز واریانس مولکولی تاج‌خروسیان تجزیه خوشه‌‌ای روش upgma Botany QK1-989 شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سیدمهدی حمدی ایرج مهرگان بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
description	جنس Seidlitzia دارای چهار گونه در ایران است. گونه S. rosmarinus به شکل درختچه‌ای و سه گونه دیگر علفی هستند. هدف از این تحقیق، بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیتی 85 نمونه گیاهی 17 جمعیت گونه S. rosmarinus و پی بردن به شناسایی احتمالی فرم‌های تاکسونومیکی پایین‌تر از سطح گونه با استفاده از نشانگر مولکولیISSR بود. از 16 پرایمر عمومی و چهار پرایمر اختصاصی استفاده شد که در مجموع 221 باند ایجاد کردند. دندروگرام داده‌هایISSR مربوط به 17 جمعیت براساس ماتریس تشابه به روشUPGMA و ضریب تشابهDice از 40/0 تا 96/0 متغیر بود. براساس آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA)، بیشترین تنوع (68%) تنوع درون جمعیتی، 28% تنوع بین جمعیتی و 4% مربوط به تنوع بین مناطق بود. آنالیزMCMC به منظور بررسی ساختار ژنتیکی در جمعیت‌های گونهS. rosmarinus مورد بررسی قرار گرفت. همچنین، آنالیز مختصات اصلی به روشPCOA براساس محور مختصات اصلی اول و دوم برای نشانگرISSR انجام شد که این روش به عنوان روش مکمل برای تجزیه خوشه‌ای با هدف استفاده بهینه و استخراج حداکثری اطلاعات از داده‌های مولکولی ارایه شد. نتایج به دست آمده از نشانگرISSR از درجه اطمینان بالایی برخوردار بود. نتایج به دست آمده با استفاده از نشانگرISSR نشان داد که نسبت به سایر نشانگرها دقت بیشتری داشته و روابط بین جمعیت‌ها را با وضوح بهتری نمایان ساخت. از طرفی، فرم‌های تاکسونومیکی احتمالی پایین‌تر از سطح گونه با توجه به اختلافات کم بین جمعیت‌ها مشاهده نشد.
format	article
author	شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سیدمهدی حمدی ایرج مهرگان
author_facet	شیما صدیقی علیرضا ایرانبخش سیدمهدی حمدی ایرج مهرگان
author_sort	شیما صدیقی
title	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
title_short	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
title_full	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
title_fullStr	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
title_full_unstemmed	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران
title_sort	بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر issr در برخی مناطق ایران
publisher	Agricultural Research, Education and Extension Organization
publishDate	2021
url	https://doaj.org/article/43c4128f9137498e9334ea5ebe44f711
work_keys_str_mv	AT sẖymạṣdyqy brrsyrwạbṭfylwzẖnywtnwʿzẖntyḵyjmʿythạyseidlitziarosmarinusbạạstfạdhạznsẖạngrissrdrbrkẖymnạṭqạyrạn AT ʿlyrḍạạyrạnbkẖsẖ brrsyrwạbṭfylwzẖnywtnwʿzẖntyḵyjmʿythạyseidlitziarosmarinusbạạstfạdhạznsẖạngrissrdrbrkẖymnạṭqạyrạn AT sydmhdyḥmdy brrsyrwạbṭfylwzẖnywtnwʿzẖntyḵyjmʿythạyseidlitziarosmarinusbạạstfạdhạznsẖạngrissrdrbrkẖymnạṭqạyrạn AT ạyrjmhrgạn brrsyrwạbṭfylwzẖnywtnwʿzẖntyḵyjmʿythạyseidlitziarosmarinusbạạstfạdhạznsẖạngrissrdrbrkẖymnạṭqạyrạn
_version_	1718442994065997824

بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت‌های Seidlitzia rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR در برخی مناطق ایران

Ejemplares similares