Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú

El cambio e intensificación de uso del suelo ha dado lugar al empobrecimiento de los suelos con efectos negativos en las comunidades biológicas. Se analizó la composición bacteriana de suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) mediante secuenciación Illumina en la meseta de Bombón, durante e...

Descripción completa

Guardado en:

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	María Custodio, Fisher Huaraca-Meza, Richard Peñaloza, Juan C. Alvarado-Ibañez, Heidi De la Cruz-Solano
Formato:	article
Lenguaje:	EN ES PT
Publicado:	Universidad Nacional de Trujillo 2021
Materias:	composición bacteriana suelo secuenciación illumina lepidium meyenii maca Agriculture S Agriculture (General) S1-972
Acceso en línea:	https://doaj.org/article/4544d2acbc1746d2a11a78f4ab37b86c
Etiquetas:	Agregar Etiqueta Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!

id	oai:doaj.org-article:4544d2acbc1746d2a11a78f4ab37b86c
record_format	dspace
spelling	oai:doaj.org-article:4544d2acbc1746d2a11a78f4ab37b86c2021-11-03T17:16:38ZComposición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú10.17268/sci.agropecu.2021.0202077-99172306-6741https://doaj.org/article/4544d2acbc1746d2a11a78f4ab37b86c2021-06-01T00:00:00Zhttps://revistas.unitru.edu.pe/index.php/scientiaagrop/article/view/3469https://doaj.org/toc/2077-9917https://doaj.org/toc/2306-6741El cambio e intensificación de uso del suelo ha dado lugar al empobrecimiento de los suelos con efectos negativos en las comunidades biológicas. Se analizó la composición bacteriana de suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) mediante secuenciación Illumina en la meseta de Bombón, durante el año 2019. Se definieron tres sectores de muestreo, un sector control (suelo natural) y dos sectores con presión de uso (suelos “primer uso” y “segundo uso”, respecto al cultivo de maca). Se determinaron los indicadores fisicoquímicos del suelo mediante métodos analíticos y la composición de las comunidades bacterianas mediante secuenciación Illumina de los amplicones del gen de ARNr 16S. Los resultados de pH y CE, en suelos control y con presión de uso, variaron de 7,51 a 4,53 y de 0,06 a 0,47 dS/m, respectivamente. Los contenidos más altos MO, N, P, K y Ca se registraron en los suelos control disminuyendo significativamente en suelos con presión de uso. El análisis de componentes principales (ACP) presentó un porcentaje de variación total del 97,1 %. La secuenciación Illumina reveló 3776 familias bacterianas. El análisis SIMPER mostró que los mayores porcentajes de contribución lo realizaron las familias Acidobacteriaceae (2,95%), Verrucomicrobiaceae (2,68%), Thermoactinomycetaceae (2,11%) y Akkermansiaceae (2,10%). El análisis de redundancia (AR) mostró una buena asociación entre las variables fisicoquímicas y las familias bacterianas. El análisis metagenómico ha permitido identificar familias bacterianas que pueden ser usadas como indicadores de buena y mala calidad fisicoquímica del suelo según presión de uso por cultivos de maca; así como, a los mejores indicadores fisicoquímicos predictores de los cambios de la composición de las comunidades bacterianas.María CustodioFisher Huaraca-MezaRichard PeñalozaJuan C. Alvarado-IbañezHeidi De la Cruz-SolanoUniversidad Nacional de Trujilloarticlecomposición bacterianasuelosecuenciación illuminalepidium meyeniimacaAgricultureSAgriculture (General)S1-972ENESPTScientia Agropecuaria, Vol 12, Iss 2, Pp 175-183 (2021)
institution	DOAJ
collection	DOAJ
language	EN ES PT
topic	composición bacteriana suelo secuenciación illumina lepidium meyenii maca Agriculture S Agriculture (General) S1-972
spellingShingle	composición bacteriana suelo secuenciación illumina lepidium meyenii maca Agriculture S Agriculture (General) S1-972 María Custodio Fisher Huaraca-Meza Richard Peñaloza Juan C. Alvarado-Ibañez Heidi De la Cruz-Solano Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
description	El cambio e intensificación de uso del suelo ha dado lugar al empobrecimiento de los suelos con efectos negativos en las comunidades biológicas. Se analizó la composición bacteriana de suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) mediante secuenciación Illumina en la meseta de Bombón, durante el año 2019. Se definieron tres sectores de muestreo, un sector control (suelo natural) y dos sectores con presión de uso (suelos “primer uso” y “segundo uso”, respecto al cultivo de maca). Se determinaron los indicadores fisicoquímicos del suelo mediante métodos analíticos y la composición de las comunidades bacterianas mediante secuenciación Illumina de los amplicones del gen de ARNr 16S. Los resultados de pH y CE, en suelos control y con presión de uso, variaron de 7,51 a 4,53 y de 0,06 a 0,47 dS/m, respectivamente. Los contenidos más altos MO, N, P, K y Ca se registraron en los suelos control disminuyendo significativamente en suelos con presión de uso. El análisis de componentes principales (ACP) presentó un porcentaje de variación total del 97,1 %. La secuenciación Illumina reveló 3776 familias bacterianas. El análisis SIMPER mostró que los mayores porcentajes de contribución lo realizaron las familias Acidobacteriaceae (2,95%), Verrucomicrobiaceae (2,68%), Thermoactinomycetaceae (2,11%) y Akkermansiaceae (2,10%). El análisis de redundancia (AR) mostró una buena asociación entre las variables fisicoquímicas y las familias bacterianas. El análisis metagenómico ha permitido identificar familias bacterianas que pueden ser usadas como indicadores de buena y mala calidad fisicoquímica del suelo según presión de uso por cultivos de maca; así como, a los mejores indicadores fisicoquímicos predictores de los cambios de la composición de las comunidades bacterianas.
format	article
author	María Custodio Fisher Huaraca-Meza Richard Peñaloza Juan C. Alvarado-Ibañez Heidi De la Cruz-Solano
author_facet	María Custodio Fisher Huaraca-Meza Richard Peñaloza Juan C. Alvarado-Ibañez Heidi De la Cruz-Solano
author_sort	María Custodio
title	Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
title_short	Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
title_full	Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
title_fullStr	Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
title_full_unstemmed	Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú
title_sort	composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (lepidium meyenii walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los andes centrales del perú
publisher	Universidad Nacional de Trujillo
publishDate	2021
url	https://doaj.org/article/4544d2acbc1746d2a11a78f4ab37b86c
work_keys_str_mv	AT mariacustodio composicionbacterianaensuelosdecultivodemacalepidiummeyeniiwalpanalizadamediantemetagenomicaunestudioenlosandescentralesdelperu AT fisherhuaracameza composicionbacterianaensuelosdecultivodemacalepidiummeyeniiwalpanalizadamediantemetagenomicaunestudioenlosandescentralesdelperu AT richardpenaloza composicionbacterianaensuelosdecultivodemacalepidiummeyeniiwalpanalizadamediantemetagenomicaunestudioenlosandescentralesdelperu AT juancalvaradoibanez composicionbacterianaensuelosdecultivodemacalepidiummeyeniiwalpanalizadamediantemetagenomicaunestudioenlosandescentralesdelperu AT heididelacruzsolano composicionbacterianaensuelosdecultivodemacalepidiummeyeniiwalpanalizadamediantemetagenomicaunestudioenlosandescentralesdelperu
_version_	1718445510178635776

Composición bacteriana en suelos de cultivo de maca (Lepidium meyenii Walp) analizada mediante metagenómica: un estudio en los Andes centrales del Perú

Ejemplares similares