Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike

Mramorirana šara pasa, nastala umetanjem kratkih ponovaca elemenata (SINE) u genetsku strukturu SILV gena, karakteriše se prisustvom slabije pigmentisanih polja pomešanih sa poljima normalne pigmentacije. Analizom SINE elementa lokalizovanog u SILV genu pasa sekvencioniranjem otkrila je varijabilnos...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autores principales: Miluchová Martina, Gábor Michal, Trakovická Anna, Hanusová Jana, Zubrická Stanislava, Zubrický Pavol
Formato: article
Lenguaje:EN
Publicado: Sciendo 2015
Materias:
dog
dna
Acceso en línea:https://doaj.org/article/46c5f6bc125e4b2f8eab57e229905bdb
Etiquetas: Agregar Etiqueta
Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!
id oai:doaj.org-article:46c5f6bc125e4b2f8eab57e229905bdb
record_format dspace
spelling oai:doaj.org-article:46c5f6bc125e4b2f8eab57e229905bdb2021-11-17T21:27:50ZIdentification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike1820-744810.1515/acve-2015-0020https://doaj.org/article/46c5f6bc125e4b2f8eab57e229905bdb2015-06-01T00:00:00Zhttps://doi.org/10.1515/acve-2015-0020https://doaj.org/toc/1820-7448Mramorirana šara pasa, nastala umetanjem kratkih ponovaca elemenata (SINE) u genetsku strukturu SILV gena, karakteriše se prisustvom slabije pigmentisanih polja pomešanih sa poljima normalne pigmentacije. Analizom SINE elementa lokalizovanog u SILV genu pasa sekvencioniranjem otkrila je varijabilnost poli(A) repa koji je odgovoran za različitu ekspresiju mramorirane šare. SINE element sa poli(A) repom dužine od 91 do 101 nukleotida je odgovoran za mramorirani fenotip sa svim karakterima mramorirane šare. Nasuprot tome, psi koji poseduju SINE element sa kratkim poli(A) repom dužine od 54 do 65 nukleotida su opisani kao prikriveni mramorirani bez ekspresije mramorirane šare. Cilj ove studije je poboljšanje metoda molekularne genetike za detekciju skrivenog alela za mramoriranu šaru pasa. Ukupno 40 pasa četiri rase: border koli, šetlandski ovčar, australijski ovčar i čivava bilo je uključeno u studiju. Genom DNK pasa bio je izolovan iz uzoraka pune krvi i ćelija sluznice usne duplje bio je izolovan pomoću komercijalnih kitova. Detekcija mramoriranog (M), prikriveno mramoriranog (Mc) i ne-mramoriranog (m) alela je izvršena pomoću „M13-tailed“ prajmera protokola i dve različite metode određivanja veličine alela za verifi kaciju rezultata elektroforeze. U analiziranoj populaciji pasa otkriveno je 20 pasa sa ne - mramoriranim genotipom mm, 17 pasa sa mramoriranim genotipom Mm, 2 psa sa duplim mramoriranim genotipom MM i jedan pas sa mramoriranim fenotipom, ali sa prisustvom prikrivenog mramoriranog alela Mc sa posledičnim genotiom MMC.Miluchová MartinaGábor MichalTrakovická AnnaHanusová JanaZubrická StanislavaZubrický PavolSciendoarticledogsilv genesine elementmerle patterncryptic allelednaVeterinary medicineSF600-1100ENActa Veterinaria, Vol 65, Iss 2, Pp 238-245 (2015)
institution DOAJ
collection DOAJ
language EN
topic dog
silv gene
sine element
merle pattern
cryptic allele
dna
Veterinary medicine
SF600-1100
spellingShingle dog
silv gene
sine element
merle pattern
cryptic allele
dna
Veterinary medicine
SF600-1100
Miluchová Martina
Gábor Michal
Trakovická Anna
Hanusová Jana
Zubrická Stanislava
Zubrický Pavol
Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
description Mramorirana šara pasa, nastala umetanjem kratkih ponovaca elemenata (SINE) u genetsku strukturu SILV gena, karakteriše se prisustvom slabije pigmentisanih polja pomešanih sa poljima normalne pigmentacije. Analizom SINE elementa lokalizovanog u SILV genu pasa sekvencioniranjem otkrila je varijabilnost poli(A) repa koji je odgovoran za različitu ekspresiju mramorirane šare. SINE element sa poli(A) repom dužine od 91 do 101 nukleotida je odgovoran za mramorirani fenotip sa svim karakterima mramorirane šare. Nasuprot tome, psi koji poseduju SINE element sa kratkim poli(A) repom dužine od 54 do 65 nukleotida su opisani kao prikriveni mramorirani bez ekspresije mramorirane šare. Cilj ove studije je poboljšanje metoda molekularne genetike za detekciju skrivenog alela za mramoriranu šaru pasa. Ukupno 40 pasa četiri rase: border koli, šetlandski ovčar, australijski ovčar i čivava bilo je uključeno u studiju. Genom DNK pasa bio je izolovan iz uzoraka pune krvi i ćelija sluznice usne duplje bio je izolovan pomoću komercijalnih kitova. Detekcija mramoriranog (M), prikriveno mramoriranog (Mc) i ne-mramoriranog (m) alela je izvršena pomoću „M13-tailed“ prajmera protokola i dve različite metode određivanja veličine alela za verifi kaciju rezultata elektroforeze. U analiziranoj populaciji pasa otkriveno je 20 pasa sa ne - mramoriranim genotipom mm, 17 pasa sa mramoriranim genotipom Mm, 2 psa sa duplim mramoriranim genotipom MM i jedan pas sa mramoriranim fenotipom, ali sa prisustvom prikrivenog mramoriranog alela Mc sa posledičnim genotiom MMC.
format article
author Miluchová Martina
Gábor Michal
Trakovická Anna
Hanusová Jana
Zubrická Stanislava
Zubrický Pavol
author_facet Miluchová Martina
Gábor Michal
Trakovická Anna
Hanusová Jana
Zubrická Stanislava
Zubrický Pavol
author_sort Miluchová Martina
title Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
title_short Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
title_full Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
title_fullStr Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
title_full_unstemmed Identification of Cryptic Allele for Merle Patterning in Dogs by Molecular Genetics Methods / Identifikacija Skrivenog Alela Za Mramoriranu Šaru Pasa Pomoću Metoda Molekularne Genetike
title_sort identification of cryptic allele for merle patterning in dogs by molecular genetics methods / identifikacija skrivenog alela za mramoriranu šaru pasa pomoću metoda molekularne genetike
publisher Sciendo
publishDate 2015
url https://doaj.org/article/46c5f6bc125e4b2f8eab57e229905bdb
work_keys_str_mv AT miluchovamartina identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
AT gabormichal identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
AT trakovickaanna identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
AT hanusovajana identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
AT zubrickastanislava identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
AT zubrickypavol identificationofcrypticalleleformerlepatterningindogsbymoleculargeneticsmethodsidentifikacijaskrivenogalelazamramoriranusarupasapomocumetodamolekularnegenetike
_version_ 1718425352150188032