Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi

Perakitan varietas padi tahan wereng batang coklat (WBC, Nilaparvata lugens Stål.) perlu diupayakan secara kontinyu untuk mengatasi perubahan genetik WBC yang terjadi secara spasial dan temporal menjadi biotipe yang lebih ganas. Tersedianya marka molekuler yang terpaut erat dengan ketahanan terhadap...

Descripción completa

Guardado en:

Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Chaerani Chaerani, Dwinita W. Utami, Nurul Hidayatun, Buang Abdullah, Bambang Suprihatno
Formato:	article
Lenguaje:	EN ID
Publicado:	The Entomological Society of Indonesia 2015
Materias:	brown planthopper resistance rice SSR Zoology QL1-991
Acceso en línea:	https://doaj.org/article/a27c2e71bb484fe6b6f5d905d308cfb7
Etiquetas:	Agregar Etiqueta Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!

id	oai:doaj.org-article:a27c2e71bb484fe6b6f5d905d308cfb7
record_format	dspace
spelling	oai:doaj.org-article:a27c2e71bb484fe6b6f5d905d308cfb72021-12-02T00:11:38ZAsosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi1829-77222089-025710.5994/jei.11.1.43https://doaj.org/article/a27c2e71bb484fe6b6f5d905d308cfb72015-09-01T00:00:00Zhttp://jurnal.pei-pusat.org/index.php/jei/article/view/52https://doaj.org/toc/1829-7722https://doaj.org/toc/2089-0257Perakitan varietas padi tahan wereng batang coklat (WBC, Nilaparvata lugens Stål.) perlu diupayakan secara kontinyu untuk mengatasi perubahan genetik WBC yang terjadi secara spasial dan temporal menjadi biotipe yang lebih ganas. Tersedianya marka molekuler yang terpaut erat dengan ketahanan terhadap WBC dapat mempercepat proses seleksi pada populasi persilangan. Marka yang terpaut erat dengan sebuah karakter fenotipe tertentu dapat diidentifikasi dengan cara mengasosiasikan sejumlah marka dengan karakter fenotipik pada individu-individu yang tidak berkerabat sebagai alternatif dari metode tradisional menggunakan analisis pautan yang memerlukan populasi persilangan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi marka simple sequence repeat (SSR) padi yang berasosiasi dengan ketahanan terhadap WBC. Sebanyak 44 varietas dan calon galur harapan yang telah diketahui tingkat ketahanannya terhadap WBC biotipe 3 dianalisis menggunakan 30 marka SSR yang tersebar di delapan kromosom padi. Uji asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap WBC mendapatkan delapan marka SSR (RM17, RM38, RM125, RM144, RM250, RM287, RM328, dan RM536) yang berasosiasi signifikan dengan ketahanan WBC (R2=0,18 sampai 0,89; P<0,05). Dua puluh satu varietas dan 11 calon galur harapan terdeteksi mengandung alel-alel SSR yang berasosiasi dengan ketahanan WBC biotipe 3. Marka RM17 terdeteksi pada 15 varietas dan 11 calon galur harapan yang dikategorikan tahan dan agak tahan sehingga berpotensi digunakan sebagai marka diagnostik awal untuk mendeteksi alel-alel ketahanan terhadap WBC. Untuk mendapatkan marka SSR yang dapat digunakan sebagai alat seleksi ketahanan WBC yang terpercaya, perlu dilakukan analisis lanjutan pada populasi yang bersegragasi untuk kedelapan marka tersebut dan uji asosiasi lebih banyak marka SSR yang tersebar luas pada kromosom padi.Chaerani ChaeraniDwinita W. UtamiNurul HidayatunBuang AbdullahBambang SuprihatnoThe Entomological Society of Indonesiaarticlebrown planthopperresistancericeSSRZoologyQL1-991ENIDJurnal Entomologi Indonesia, Vol 11, Iss 1 (2015)
institution	DOAJ
collection	DOAJ
language	EN ID
topic	brown planthopper resistance rice SSR Zoology QL1-991
spellingShingle	brown planthopper resistance rice SSR Zoology QL1-991 Chaerani Chaerani Dwinita W. Utami Nurul Hidayatun Buang Abdullah Bambang Suprihatno Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
description	Perakitan varietas padi tahan wereng batang coklat (WBC, Nilaparvata lugens Stål.) perlu diupayakan secara kontinyu untuk mengatasi perubahan genetik WBC yang terjadi secara spasial dan temporal menjadi biotipe yang lebih ganas. Tersedianya marka molekuler yang terpaut erat dengan ketahanan terhadap WBC dapat mempercepat proses seleksi pada populasi persilangan. Marka yang terpaut erat dengan sebuah karakter fenotipe tertentu dapat diidentifikasi dengan cara mengasosiasikan sejumlah marka dengan karakter fenotipik pada individu-individu yang tidak berkerabat sebagai alternatif dari metode tradisional menggunakan analisis pautan yang memerlukan populasi persilangan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi marka simple sequence repeat (SSR) padi yang berasosiasi dengan ketahanan terhadap WBC. Sebanyak 44 varietas dan calon galur harapan yang telah diketahui tingkat ketahanannya terhadap WBC biotipe 3 dianalisis menggunakan 30 marka SSR yang tersebar di delapan kromosom padi. Uji asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap WBC mendapatkan delapan marka SSR (RM17, RM38, RM125, RM144, RM250, RM287, RM328, dan RM536) yang berasosiasi signifikan dengan ketahanan WBC (R2=0,18 sampai 0,89; P<0,05). Dua puluh satu varietas dan 11 calon galur harapan terdeteksi mengandung alel-alel SSR yang berasosiasi dengan ketahanan WBC biotipe 3. Marka RM17 terdeteksi pada 15 varietas dan 11 calon galur harapan yang dikategorikan tahan dan agak tahan sehingga berpotensi digunakan sebagai marka diagnostik awal untuk mendeteksi alel-alel ketahanan terhadap WBC. Untuk mendapatkan marka SSR yang dapat digunakan sebagai alat seleksi ketahanan WBC yang terpercaya, perlu dilakukan analisis lanjutan pada populasi yang bersegragasi untuk kedelapan marka tersebut dan uji asosiasi lebih banyak marka SSR yang tersebar luas pada kromosom padi.
format	article
author	Chaerani Chaerani Dwinita W. Utami Nurul Hidayatun Buang Abdullah Bambang Suprihatno
author_facet	Chaerani Chaerani Dwinita W. Utami Nurul Hidayatun Buang Abdullah Bambang Suprihatno
author_sort	Chaerani Chaerani
title	Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
title_short	Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
title_full	Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
title_fullStr	Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
title_full_unstemmed	Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
title_sort	asosiasi antara marka ssr dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi
publisher	The Entomological Society of Indonesia
publishDate	2015
url	https://doaj.org/article/a27c2e71bb484fe6b6f5d905d308cfb7
work_keys_str_mv	AT chaeranichaerani asosiasiantaramarkassrdenganketahananterhadapwerengbatangcoklatpadavarietasdancalongalurharapanpadi AT dwinitawutami asosiasiantaramarkassrdenganketahananterhadapwerengbatangcoklatpadavarietasdancalongalurharapanpadi AT nurulhidayatun asosiasiantaramarkassrdenganketahananterhadapwerengbatangcoklatpadavarietasdancalongalurharapanpadi AT buangabdullah asosiasiantaramarkassrdenganketahananterhadapwerengbatangcoklatpadavarietasdancalongalurharapanpadi AT bambangsuprihatno asosiasiantaramarkassrdenganketahananterhadapwerengbatangcoklatpadavarietasdancalongalurharapanpadi
_version_	1718403880143814656

Asosiasi antara marka SSR dengan ketahanan terhadap wereng batang coklat pada varietas dan calon galur harapan padi

Ejemplares similares