Aislamiento de microRNAs a partir de células clorofílicas de Bouteloua gracilis y su caracterización in silico

Bouteloua gracilis es un pasto nativo del norte de México, que es utilizado como fuente de forraje para el ganado por su alto contenido nutritivo; tiene elevada tolerancia al estrés osmótico que le permite vivir en climas secos; sin embargo, los mecanismos moleculares que le confieren esta toleranci...

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Detalles Bibliográficos
Autores principales:	Perla Lucía Ordóñez-Baquera, Everardo González Rodríguez, Gerardo Armando Aguado Santacruz, Quintín Rascón Cruz, Eduviges Burrola Barraza
Formato:	article
Lenguaje:	EN ES
Publicado:	Instituto Nacional del Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias 2016
Materias:	navajita azul mirnas regulación genética análisis bioinformático Animal culture SF1-1100 Veterinary medicine SF600-1100
Acceso en línea:	https://doi.org/10.22319/rmcp.v7i3.4209 https://doaj.org/article/cd67a75441444e26b64e0f2578834159
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spelling	oai:doaj.org-article:cd67a75441444e26b64e0f25788341592021-12-01T01:11:53ZAislamiento de microRNAs a partir de células clorofílicas de Bouteloua gracilis y su caracterización in silicohttps://doi.org/10.22319/rmcp.v7i3.42092007-11242448-6698https://doaj.org/article/cd67a75441444e26b64e0f25788341592016-07-01T00:00:00Zhttps://doaj.org/toc/2007-1124https://doaj.org/toc/2448-6698Bouteloua gracilis es un pasto nativo del norte de México, que es utilizado como fuente de forraje para el ganado por su alto contenido nutritivo; tiene elevada tolerancia al estrés osmótico que le permite vivir en climas secos; sin embargo, los mecanismos moleculares que le confieren esta tolerancia aún no se han reportado. Existe una clase de RNAs pequeños (sRNAs) llamados microRNAs (miRNAs), que se unen por complementariedad a RNAs mensajeros blanco, etiquetándolos para su degradación o supresión de la traducción. En este trabajo se reporta el aislamiento de sRNAs de B. gracilis, a través de la clonación de concatámeros y su secuenciación. El análisis in silico de la secuencias, permitió la identificación de miRNAs conservados en B. gracilis y reportados en Populus trichocarpa, Brachypodium distachyon, Oryza sativa, Sorghum bicolor, Zea mays, Malus domestica y Linum usitatissimum. Además, se predijo la estructura secundaria de los precursores de dos miRNAs (pre-miRNAs), usando como referencia los genomas de Glycine max, Zea mays, Sorghum bicolor y Oryza sativa. Finalmente, se identificaron seis mRNAs blanco para uno de ellos. La identificación de miRNAs en Bouteloua gracilis, ayudará a comprender como estas moléculas regulan la expresión genética en esta especie, y sus relaciones con los mecanismos de respuesta a estrés ambiental.Perla Lucía Ordóñez-BaqueraEverardo González RodríguezGerardo Armando Aguado SantacruzQuintín Rascón CruzEduviges Burrola BarrazaInstituto Nacional del Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuariasarticlenavajita azulmirnasregulación genéticaanálisis bioinformáticoAnimal cultureSF1-1100Veterinary medicineSF600-1100ENESRevista Mexicana de Ciencias Pecuarias, Vol 7, Iss 3, Pp 263-274 (2016)
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description	Bouteloua gracilis es un pasto nativo del norte de México, que es utilizado como fuente de forraje para el ganado por su alto contenido nutritivo; tiene elevada tolerancia al estrés osmótico que le permite vivir en climas secos; sin embargo, los mecanismos moleculares que le confieren esta tolerancia aún no se han reportado. Existe una clase de RNAs pequeños (sRNAs) llamados microRNAs (miRNAs), que se unen por complementariedad a RNAs mensajeros blanco, etiquetándolos para su degradación o supresión de la traducción. En este trabajo se reporta el aislamiento de sRNAs de B. gracilis, a través de la clonación de concatámeros y su secuenciación. El análisis in silico de la secuencias, permitió la identificación de miRNAs conservados en B. gracilis y reportados en Populus trichocarpa, Brachypodium distachyon, Oryza sativa, Sorghum bicolor, Zea mays, Malus domestica y Linum usitatissimum. Además, se predijo la estructura secundaria de los precursores de dos miRNAs (pre-miRNAs), usando como referencia los genomas de Glycine max, Zea mays, Sorghum bicolor y Oryza sativa. Finalmente, se identificaron seis mRNAs blanco para uno de ellos. La identificación de miRNAs en Bouteloua gracilis, ayudará a comprender como estas moléculas regulan la expresión genética en esta especie, y sus relaciones con los mecanismos de respuesta a estrés ambiental.
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Aislamiento de microRNAs a partir de células clorofílicas de Bouteloua gracilis y su caracterización in silico

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