Implementación de un control interno en la detección molecular de las principales especies de micoplasmas contaminantes de cultivos celulares

Objetivo: Construir e implementar un control interno para la detección molecular de micoplasmas en cultivos celulares. Materiales y métodos: Se alinearon secuencias del RNA ribosomal 16S de las princi- pales especies de micoplasmas reportadas como contaminantes de cultivos, y diseñaron oligonucleóti...

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Autores principales: Juan D. Puerta, José A. Usme-Ciro, Juan C. Gallego-Gómez
Formato: article
Lenguaje:EN
ES
Publicado: Universidad del Norte 2013
Materias:
pcr
R
Acceso en línea:https://doaj.org/article/d14b6b7b7b7c40e0942cb0afb0020c19
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Implementación de un control interno en la detección molecular de las principales especies de micoplasmas contaminantes de cultivos celulares
description Objetivo: Construir e implementar un control interno para la detección molecular de micoplasmas en cultivos celulares. Materiales y métodos: Se alinearon secuencias del RNA ribosomal 16S de las princi- pales especies de micoplasmas reportadas como contaminantes de cultivos, y diseñaron oligonucleótidos para la detección de las mismas. Para la construcción del control interno se amplificó una secuencia espaciadora, además de las secuencias de hibridación de los oligonucleótidos usados para detección. La amplificación desde dicho control generó un fragmento con tamaño diferente al obtenido desde una muestra positiva. Posteriormente, para la evaluación del efecto del control interno sobre la amplificación de una muestra po- sitiva se realizó la prueba sobre diluciones seriadas de la muestra, en presencia y ausencia del control interno. Finalmente, se ensayó el protocolo utilizando sobrenadantes de cultivo provenientes de diferentes laboratorios. Resultados: Se observó alta homogeneidad al comparar los géneros Mycoplasma y Acho- leplasma; no obstante se realizó el diseño de oligonucleótidos degenerados para aumentar teóricamente la eficiencia en la detección de todas las especies. Se demostró que la aplica- ción del control interno no afecta la sensibilidad de detección de la prueba. Los resultados obtenidos con muestras problema resaltan la importancia del control interno al realizar la prueba desde sobrenadantes de cultivo. Conclusiones: El uso del control interno evita la obtención de resultados falsos negativos, generados por presencia de inhibidores en la muestra. La implementación de la prueba beneficiará los laboratorios en cuyas investigaciones utilicen cultivos celulares y permitirá ejercer un control de calidad, lo cual hará más confiables los resultados/productos obteni- dos. Palabras clave: Detección molecular, PCR, control interno, micoplasma, contami- nación, cultivos celulares.
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