De novo compartment deconvolution and weight estimation of tumor samples using DECODER

Separating different cell compartments from bulk gene expression data can be challenging. Here the authors present DECODER, which can perform de novo deconvolutions on non-negative matrices including microarray, RNA-seq and ATAC-seq data sets.

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Detalles Bibliográficos
Autores principales: Xianlu Laura Peng, Richard A. Moffitt, Robert J. Torphy, Keith E. Volmar, Jen Jen Yeh
Formato: article
Lenguaje:EN
Publicado: Nature Portfolio 2019
Materias:
Q
Acceso en línea:https://doaj.org/article/d36eff381c324e13b089aca37650d569
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