Mapeo genético y detección de QTLs en especies de Solanum
Con el objetivo de mostrar las técnicas de mapeo genético y QTL, así como el potencial de una de las especies silvestres de Solanum, se investigó las bases moleculares de la resistencia al frío en 2 especies silvestres. Inicialmente, se procedió con la construcción de un mapa genético y posteri...
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Publicado: |
Universidad de Costa Rica
2007
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oai:doaj.org-article:e04db05644f14688a7da3c3bf4c19d272021-11-11T15:12:13ZMapeo genético y detección de QTLs en especies de Solanum0377-94242215-2202https://doaj.org/article/e04db05644f14688a7da3c3bf4c19d272007-01-01T00:00:00Zhttp://www.redalyc.org/articulo.oa?id=43631207https://doaj.org/toc/0377-9424https://doaj.org/toc/2215-2202Con el objetivo de mostrar las técnicas de mapeo genético y QTL, así como el potencial de una de las especies silvestres de Solanum, se investigó las bases moleculares de la resistencia al frío en 2 especies silvestres. Inicialmente, se procedió con la construcción de un mapa genético y posteriormente con el análisis de QTL (Quantitative trait locus) tanto para la resistencia como para la aclimatación al frío. Se utilizó una población F1 de 73 individuos, proveniente de un cruce recíproco entre S. commersonii y S. cardiphyllum. En el estudio 420 RAPDs (random amplified polymorphic DNA) y 64 AFLP (amplified fragment lenght polymorphysm) correspondientes a combinaciones de EcoRI/MseI fueron evaluados en ambas especies parentales. Se obtuvo 953 polimorfismos, donde 177 fueron específicos de S. commersonii y mostraron una segregación 1:1 en la población F1. El análisis de ligamiento dio como resultado 95 marcadores ubicados en 12 grupos de ligamiento, que corresponden al número haploide de esta especie. El tamaño acumulado de este mapa, específico de S. commersonii, fue de 194,5 cM, con un promedio de 2,05 cM entre loci. El análisis de QTL reveló la presencia de un sólo QTL para la aclimatación al frío. Y el análisis de regresión múltiple identificó 2 marcadores que explican el 22,3% de la variación en la resistencia al frío y 5 marcadores que explican el 43,8% de la variación relacionada con la aclimatación al frío.Roberto ValverdeUniversidad de Costa Ricaarticleqtlsolanumresistencia al fríoaclimataciónmapeo genéticoAgricultureSAgriculture (General)S1-972ESAgronomía Costarricense, Vol 31, Iss 2, Pp 31-47 (2007) |
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Con el objetivo de mostrar las técnicas de
mapeo genético y QTL, así como el potencial de
una de las especies silvestres de Solanum, se investigó
las bases moleculares de la resistencia al frío
en 2 especies silvestres. Inicialmente, se procedió
con la construcción de un mapa genético y posteriormente
con el análisis de QTL (Quantitative
trait locus) tanto para la resistencia como para la
aclimatación al frío. Se utilizó una población F1 de
73 individuos, proveniente de un cruce recíproco
entre S. commersonii y S. cardiphyllum. En el
estudio 420 RAPDs (random amplified polymorphic
DNA) y 64 AFLP (amplified fragment lenght
polymorphysm) correspondientes a combinaciones
de EcoRI/MseI fueron evaluados en ambas
especies parentales. Se obtuvo 953 polimorfismos,
donde 177 fueron específicos de S. commersonii
y mostraron una segregación 1:1 en la población
F1. El análisis de ligamiento dio como resultado
95 marcadores ubicados en 12 grupos de ligamiento,
que corresponden al número haploide de
esta especie. El tamaño acumulado de este mapa,
específico de S. commersonii, fue de 194,5 cM,
con un promedio de 2,05 cM entre loci. El análisis
de QTL reveló la presencia de un sólo QTL para
la aclimatación al frío. Y el análisis de regresión
múltiple identificó 2 marcadores que explican el
22,3% de la variación en la resistencia al frío y 5
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