Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I

La identificación precisa de insectos tiene un rol primordial en la asignación específica de plagas que afectan los cultivos, siendo las similitudes morfológicas en muchas especies el gran reto que enfrentan los entomólogos, es por esto que las metodologías basadas en ADN son utilizadas como complem...

Descripción completa

Guardado en:
Detalles Bibliográficos
Autores principales: Ortega Ramirez,Eddy, Ureta Sierra,Cledy, Mayanga Herrera,Ana, Morey León,Gabriel, Graterol Caldera,Lissette, Dyer Coriat,Piero, Mialhe,Eric
Lenguaje:Spanish / Castilian
Publicado: Universidad de Tarapacá. Facultad de Ciencias Agronómicas 2014
Materias:
Acceso en línea:http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-34292014000400005
Etiquetas: Agregar Etiqueta
Sin Etiquetas, Sea el primero en etiquetar este registro!
id oai:scielo:S0718-34292014000400005
record_format dspace
spelling oai:scielo:S0718-342920140004000052015-01-30Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase IOrtega Ramirez,EddyUreta Sierra,CledyMayanga Herrera,AnaMorey León,GabrielGraterol Caldera,LissetteDyer Coriat,PieroMialhe,Eric Caracterización molecular Prodiplosis sp mosquilla del brote Cecidomyiidae Espárrago Citocromo oxidasa I secuenciamiento DNA Bioinformática La identificación precisa de insectos tiene un rol primordial en la asignación específica de plagas que afectan los cultivos, siendo las similitudes morfológicas en muchas especies el gran reto que enfrentan los entomólogos, es por esto que las metodologías basadas en ADN son utilizadas como complemento a los métodos morfológicos. El espárrago (Asparagus officinalis) es el cultivo de mayor importancia económica en el Perú, en donde el insecto polífago Prodiplosis sp. (Diptera: Cecidomyiidae) es su principal plaga, mermando la producción hasta 50%. En el presente estudio se utilizó el ADNmt de Prodiplosis sp. para la identificación molecular y análisis de diversidad en 34 larvas colectadas de los cultivos de Asparagus officinalis, Capsicum annuum y Citrus spp. Fragmentos de 490 pb y 712 pb del gen de citocromo oxidasa I fueron amplificados por PCR seguidos de secuenciamiento directo. La divergencia de las secuencias nucleotídicas utilizando el modelo de distancia Kimura dos parámetros, muestra la conformación de dos clados agrupados indistintamente del hospedero. El análisis de diversidad genética en la población, dentro de las poblaciones y entre poblaciones fue de 0,019; 0,005 y 0,014, respectivamente, mostrando escasa divergencia, la variabilidad dentro de los grupos y entre grupos fue 26,7% y 73,3%. Los resultados del análisis AMOVA entre poblaciones (-1,13%) y los valores estadísticos (0,01129) fueron bajos, lo que se explica por el alto flujo de genes Nm (43,79), sugiriendo que los cultivos en estudio están afectados por una misma plaga con dos haplotipos (h1: TC y h2: GT). En conclusión, basados en la sensibilidad y especificidad de la PCR sumados a la información en las secuencias del ADNmt se puede sugerir que la prueba desarrollada serviría complementariamente a la identificación morfológica y puede ser aplicada en estudios de diversidad genética de Prodiplosis sp. en otros cultivos.info:eu-repo/semantics/openAccessUniversidad de Tarapacá. Facultad de Ciencias AgronómicasIdesia (Arica) v.32 n.4 20142014-11-01text/htmlhttp://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-34292014000400005es10.4067/S0718-34292014000400005
institution Scielo Chile
collection Scielo Chile
language Spanish / Castilian
topic Caracterización molecular
Prodiplosis sp
mosquilla del brote
Cecidomyiidae
Espárrago
Citocromo oxidasa I
secuenciamiento DNA
Bioinformática
spellingShingle Caracterización molecular
Prodiplosis sp
mosquilla del brote
Cecidomyiidae
Espárrago
Citocromo oxidasa I
secuenciamiento DNA
Bioinformática
Ortega Ramirez,Eddy
Ureta Sierra,Cledy
Mayanga Herrera,Ana
Morey León,Gabriel
Graterol Caldera,Lissette
Dyer Coriat,Piero
Mialhe,Eric
Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
description La identificación precisa de insectos tiene un rol primordial en la asignación específica de plagas que afectan los cultivos, siendo las similitudes morfológicas en muchas especies el gran reto que enfrentan los entomólogos, es por esto que las metodologías basadas en ADN son utilizadas como complemento a los métodos morfológicos. El espárrago (Asparagus officinalis) es el cultivo de mayor importancia económica en el Perú, en donde el insecto polífago Prodiplosis sp. (Diptera: Cecidomyiidae) es su principal plaga, mermando la producción hasta 50%. En el presente estudio se utilizó el ADNmt de Prodiplosis sp. para la identificación molecular y análisis de diversidad en 34 larvas colectadas de los cultivos de Asparagus officinalis, Capsicum annuum y Citrus spp. Fragmentos de 490 pb y 712 pb del gen de citocromo oxidasa I fueron amplificados por PCR seguidos de secuenciamiento directo. La divergencia de las secuencias nucleotídicas utilizando el modelo de distancia Kimura dos parámetros, muestra la conformación de dos clados agrupados indistintamente del hospedero. El análisis de diversidad genética en la población, dentro de las poblaciones y entre poblaciones fue de 0,019; 0,005 y 0,014, respectivamente, mostrando escasa divergencia, la variabilidad dentro de los grupos y entre grupos fue 26,7% y 73,3%. Los resultados del análisis AMOVA entre poblaciones (-1,13%) y los valores estadísticos (0,01129) fueron bajos, lo que se explica por el alto flujo de genes Nm (43,79), sugiriendo que los cultivos en estudio están afectados por una misma plaga con dos haplotipos (h1: TC y h2: GT). En conclusión, basados en la sensibilidad y especificidad de la PCR sumados a la información en las secuencias del ADNmt se puede sugerir que la prueba desarrollada serviría complementariamente a la identificación morfológica y puede ser aplicada en estudios de diversidad genética de Prodiplosis sp. en otros cultivos.
author Ortega Ramirez,Eddy
Ureta Sierra,Cledy
Mayanga Herrera,Ana
Morey León,Gabriel
Graterol Caldera,Lissette
Dyer Coriat,Piero
Mialhe,Eric
author_facet Ortega Ramirez,Eddy
Ureta Sierra,Cledy
Mayanga Herrera,Ana
Morey León,Gabriel
Graterol Caldera,Lissette
Dyer Coriat,Piero
Mialhe,Eric
author_sort Ortega Ramirez,Eddy
title Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
title_short Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
title_full Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
title_fullStr Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
title_full_unstemmed Molecular identification of gall midge Prodiplosis sp. Gagné in Asparagus officinalis L. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase I
title_sort molecular identification of gall midge prodiplosis sp. gagné in asparagus officinalis l. crops by partial amplification of the gene cytochrome oxidase i
publisher Universidad de Tarapacá. Facultad de Ciencias Agronómicas
publishDate 2014
url http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-34292014000400005
work_keys_str_mv AT ortegaramirezeddy molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT uretasierracledy molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT mayangaherreraana molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT moreyleongabriel molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT graterolcalderalissette molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT dyercoriatpiero molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
AT mialheeric molecularidentificationofgallmidgeprodiplosisspgagneinasparagusofficinalislcropsbypartialamplificationofthegenecytochromeoxidasei
_version_ 1714203702358704128