Sequence element enrichment analysis to determine the genetic basis of bacterial phenotypes

par John A. Lees, Minna Vehkala, Niko Välimäki, Simon R. Harris, Claire Chewapreecha, Nicholas J. Croucher, Pekka Marttinen, Mark R. Davies, Andrew C. Steer, Steven Y. C. Tong, Antti Honkela, Julian Parkhill, Stephen D. Bentley, Jukka Corander
Publié 2016

Parity associates with chromosomal damage in uterine leiomyomas

par Heli Kuisma, Simona Bramante, Kristiina Rajamäki, Lauri J. Sipilä, Eevi Kaasinen, Jaana Kaukomaa, Kimmo Palin, Netta Mäkinen, Jari Sjöberg, Nanna Sarvilinna, Jussi Taipale, Liisa Kauppi, Manuela Tumiati, Antti Hassinen, Janne Pitkäniemi, Jyrki Jalkanen, Sanna Heikkinen, Annukka Pasanen, Oskari Heikinheimo, Ralf Bützow, Niko Välimäki, Lauri A. Aaltonen
Publié 2021

Retrotransposon insertions can initiate colorectal cancer and are associated with poor survival

par Tatiana Cajuso, Päivi Sulo, Tomas Tanskanen, Riku Katainen, Aurora Taira, Ulrika A. Hänninen, Johanna Kondelin, Linda Forsström, Niko Välimäki, Mervi Aavikko, Eevi Kaasinen, Ari Ristimäki, Selja Koskensalo, Anna Lepistö, Laura Renkonen-Sinisalo, Toni Seppälä, Teijo Kuopio, Jan Böhm, Jukka-Pekka Mecklin, Outi Kilpivaara, Esa Pitkänen, Kimmo Palin, Lauri A. Aaltonen
Publié 2019

Publisher Correction: Genomic signatures of human and animal disease in the zoonotic pathogen Streptococcus suis

par Lucy A. Weinert, Roy R. Chaudhuri, Jinhong Wang, Sarah E. Peters, Jukka Corander, Thibaut Jombart, Abiyad Baig, Kate J. Howell, Minna Vehkala, Niko Välimäki, David Harris, Tran Thi Bich Chieu, Nguyen Van Vinh Chau, James Campbell, Constance Schultsz, Julian Parkhill, Stephen D. Bentley, Paul R. Langford, Andrew N. Rycroft, Brendan W. Wren, Jeremy Farrar, Stephen Baker, Ngo Thi Hoa, Matthew T. G. Holden, Alexander W. Tucker, Duncan J. Maskell, BRaDP1T Consortium
Publié 2019

Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer

par Kimmo Palin, Esa Pitkänen, Mikko Turunen, Biswajyoti Sahu, Päivi Pihlajamaa, Teemu Kivioja, Eevi Kaasinen, Niko Välimäki, Ulrika A. Hänninen, Tatiana Cajuso, Mervi Aavikko, Sari Tuupanen, Outi Kilpivaara, Linda van den Berg, Johanna Kondelin, Tomas Tanskanen, Riku Katainen, Marta Grau, Heli Rauanheimo, Roosa-Maria Plaketti, Aurora Taira, Päivi Sulo, Tuomo Hartonen, Kashyap Dave, Bernhard Schmierer, Sandeep Botla, Maria Sokolova, Anna Vähärautio, Kornelia Gladysz, Halit Ongen, Emmanouil Dermitzakis, Jesper Bertram Bramsen, Torben Falck Ørntoft, Claus Lindbjerg Andersen, Ari Ristimäki, Anna Lepistö, Laura Renkonen-Sinisalo, Jukka-Pekka Mecklin, Jussi Taipale, Lauri A. Aaltonen
Publié 2018